加利福利亚脑炎病毒染料法荧光定量RT-PCR试剂盒
产品名称 California Encephalitis Virus SYBR qRT-PCR Kit 产品介绍
产品及特点 加利福利亚脑炎病毒(California Encephalitis Virus)是一种DNA病毒,会引起加利福尼亚脑炎,是一种经蚊虫媒介传播的中枢神经系统性疾病。轻者以发热、头痛、咽痛及胃肠道症状起病,2周内出现神经系统的症状和体征。主要表现为发热、嗜睡、局灶性神经功能障碍,警觉性和定向力障碍等。癫痫也是常见的症状,可发生于50%的儿童患者,因此灵敏快捷的诊断产品具有重要的意义。本产品基于PCR原理开发。它具有下列特点: 1、一站式,用于不需要单独准备每种成分,包括引物和对照。 2、根据加利福利亚脑炎病毒的保守基因序列设计的引物,具有良好的特异性。 3、基于染料法qRT-PCR检测,灵敏度比常规RT-PCR高10-100倍,可以达到至少1000拷贝/反应。 4、使用一管式qRT-PCR技术,RT和PCR两步在一个试管内完成,不需要中间转移样品,降低了操作误差和可能的污染。 5、本产品足够50次30μL体系的RT-PCR,只能用于科研,不能用于临床。 规格及成分
运输及保存 低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。阳性对照需要因易污染其他成分需要单独放置。本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供DNA片段作为阳性对照。 自备试剂 样品DNA 使用方法 一、稀释阳性对照(以102-107这6个10倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原。 1、标记6个离心管,分别为7,6,5,4,3,2。用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,**用带芯枪头,下同)。 2、在7号管中加入5 μL 1×108拷贝/μL的阳性对照(本试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×107拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。 3、换枪头,在6号管中加入5 μL 1×107拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×106拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。 4、换枪头,在5号管中加入5 μL 1×106拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×105拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。重复上面的操作直到得到6个稀释度的阳性对照。放冰上待用。 二、样品DNA的制备 5、如果有N个样品,必须设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10μL上步制备的阳性对照梯度稀释液中的第4号(浓度为1×104拷贝/μL,10μL相当于1万拷贝)再加上一定量的水作为制备的阳性对照(加水后其总体积跟样品一样,样品体积多少取决于所用试剂盒的要求)。可以用水作为制备的阴性对照。 6、用自选方法纯化N+2个样品的DNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒DNA提取试剂盒兼容。本试剂盒免费赠送20次免DNA提取的核酸释放剂试用装。 三、设置RT-PCR反应(20μL体系,在样品制备室进行) 7、如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照,6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(用第4号阳性对照稀释液做模板)。下面只描述定量分析的步骤,定性分析只是把6个标曲反应缩减成1个,其余不变。 8、在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,阳性对照样品要等所有管子盖上盖子后最后加):
注:需使用ROX染料I的机型:ABI Prism7000、7300、7700、7900HT、Step-One、Step-One Plus。 需使用ROX染料II的机型::ABI Prism 7500、7500Fast、MJ Research的Chromo4、Opticon(II)Corbett Rotor Gene 3000。 不需要使用ROX的机型:Thermal Cycle Dice Real Time System, LightCycler、Smart Cycler System、Agilent Mx3000P、RotorGene 3000、RotorGene 6000。 9、上机后按下面参数进行RT-PCR(参数可能会因仪器不同而需优化)。
四、数据处理 10、如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值,再推算出其浓度。 11、如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于30。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于35则为阳性。如果在35-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。 |
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