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无色杆菌属通用染料法荧光定量PCR试剂盒
包装:50次


产品名称
Achromobacter spp. SYBR qPCR Kit
产品介绍

产品及特点

无色杆菌属(Achromobacter spp.)是寄生于昆虫病原线虫肠道内的一种共生细菌,该细菌通过与其共生的线虫携带,无色杆菌有多种方式可以侵入寄主昆虫,在这个过程中,共生细菌在其中也起了很关键的作用,细菌在虫体内大量繁殖,分解其中的营养物质,并产生一些抑菌物质,减少其它微生物的污染,因此快速检测无色杆菌属通用具有重要意义。荧光定量PCR是检测传染性疾病的主流技术,本产品就是以染料法荧光定量PCR技术为基础开发的专门检测无色杆菌属通用的试剂盒,它具有下列特点:

1、即开即用,用户只需要提供DNA模板。

2、特异性高,引物是根据人无色杆菌属通用高度保守区设计,不会扩增其他细菌。

3、引物和扩增体系经过优化,灵敏性比常规PCR高100倍。

4、提供无传染性的PCR阳性对照,便于区分假阴性样品。

5、一管式操作,荧光PCR检测,不容易产生环境污染。

6、本产品只能用于科研,本试剂盒足够50次20μL体系的PCR。

规格及成分

成分

编号

十孔盒包装

2×qPCR MagicMix

90408

0.5 mL(棕色)

荧光PCR专用模板稀释液

180701

1 mL(亮黄盖)

无色杆菌属通用PCR引物混合液

14-17600yw

100μL(白盖)

无色杆菌属通用PCR阳性对照(1×108拷贝/μL)

14-17600pc

50 μL(红盖)

核酸释放剂试用装

61202

20次(1mL,绿盖)

使用手册

14-17600sc

1份

运输及保存

低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。

自备试剂

样品DNA。

使用方法

一、制备标准曲线样品(以102-107拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。

由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。

1、标记6个离心管,分别为7,6,5,4,3,2。

2、用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,**用带芯枪头,下同)。

3、在7号管中加入5 μL阳性对照(其浓度为1×108拷贝/μL,试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×107拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

4、换枪头,在6号管中加入5 μL 1×107拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×106拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

5、换枪头,在5号管中加入5 μL 1×106拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×105拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。

6、重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。

二、样品DNA的制备

7、用自选方法纯化样品的DNA,本产品跟市场上绝大多数核酸纯化产品兼容。

8、如果有N个样品,则需要进行N+2个样品提取,多出的一个用作样品制备阳性对照管、另一个用作样品制备阴性对照管。本试剂盒免费赠送20次免DNA提取的核酸释放剂试用装,该释放剂的裂解液可以直接作为PCR模板,省略了DNA提取步骤。

三、设置qPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)

9、如果进行定量分析,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照,6个用于标准曲线样品。如果做定性分析,则6个标准曲线样品只选一个做(可以选4号,其余样品不变)。以下只介绍定量分析的反应设置。

10、在标记管中按下表加入各成分:

成分

N+2

样品管

PCR阴性对照管

标准曲线

样品管(2-7管)

2×qPCR MagicMix

10μL

10μL

各10μL

无色杆菌属通用PCR引物混合液

2 μL

2 μL

各2 μL

自备10×ROX (见注)

2 μL

2 μL

各2 μL

N+2个待测样品DNA模板

6 μL

不加

不加

自备超纯水

不加

6 μL

不加

第7步所得标准曲线样品稀释液(2-7号)

不加

不加

各6μL(2号样到2号管,3号样到3号管…)

注:仅ABI7500、7700和7900仪器需要使用ROX作为对照,其他荧光PCR仪器(如iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000和LightCycler480)不需要使用ROX,则用水替代。

11、盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR(具体PCR参数可以根据仪器不同而自行优化)。

四、荧光定量PCR反应参数

过程

温度

时间

预变性

94℃

5 min

PCR反应

(40个循环)

94℃

0.5 min

50℃

0.5 min(采集SYBR通道的荧光信号)

72℃

0.5 min

最后延伸

72℃

10  min

五、数据处理

12、设定60℃-96℃范围的融解曲线分析,排除假阳性。

13、如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值,再推算出其浓度。

14、如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于30。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于35则为阳性。如果在35-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。

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