放线菌属通用探针法荧光定量PCR试剂盒
产品名称 Actinomyces spp. Probe qPCR Kit 产品介绍
产品及特点 放线菌(Actinomyces spp.)在自然界分布广泛,主要以孢子或菌丝状态存 在于土壤、空气和水中,尤其是含水量低、有机物丰富、呈中性或微碱性的土壤中数量最多。放线菌是一类极其重要的微生物资源。放线菌与人类的生产和生活关系极为密切,广泛应用的抗生素约 70%是各种放线菌所产生。一些种类的放线菌还能产生各种酶制剂(蛋白酶、淀粉酶、和纤维素酶等)、维生素(B12)和有机酸等。此外,放线菌还可用于甾体转化、烃类发酵、石油脱蜡和污水处理等方面。少数放线菌也会对人类构成危害,引起人和动植物病害。因此,放线菌与人类关系密切,在医药工业上有重要意义,检测放线菌具有重要的意义。本公司开发了简单快捷的放线菌属通用探针法荧光定量 PCR检测试剂盒,它具有下列特点: 1、即开即用,用户只需要提供样品 DNA模板。 2、根据放线菌保守区域设计引物和探针,能专一性地检测出样品中的放线菌。 3、提供阳性对照,便于区分假阴性样品。 4、一管式闭管操作,降低了交叉污染。 5、本产品只能用于科研,足够 50次 20μL体系的荧光定量 PCR。 规格及成分
运输及保存 低温运输,-20℃保存,保存期限为 12个月。 自备试剂 样品 DNA。 使用方法 一、稀释标准曲线样品(以 102-107拷贝/μL这 6个 10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分) 1、标记 6个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。 2、用带芯枪头分别加入 45 μL荧光 PCR专用模板稀释液,**用带芯枪头,下同)。 3、在 7号管中加入 5 μL 1×108拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1分钟,得 1×107拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。 4、换枪头,在 6号管中加入 5 μL 1×107拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1分钟,得 1×106拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。 5、换枪头,在 5号管中加入 5 μL 1×106拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1分钟,得 1×105拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。 6、重复上面的操作直到得到 6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。 二、样品 DNA的制备 7、如果有 N个样品,**设置 N+2个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL阳性对照的 10000倍稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为 PC。另外用水作为 NC。 8、用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数 DNA提取试剂盒兼容。 三、Probe qPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行) 9、如果做定量分析并且只做 1次重复,则标记 N+9个 PCR管,其中 N+2个用于上步得到的 N+2个样品,1个用于 PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1次重复,则标记 N+4个 PCR管,其中 N+2个用于上步得到的 N+2个样品,1个用于 PCR阴性对照(用水做模板),1个用于 PCR阳性对照(用第 4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。 10、在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
11、盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR:
四、数据处理 12、如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log值为横轴,以 Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct值从标准曲线上推算出样品 RNA浓度的 log值,再推算出其浓度。 13、如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct必须大于或等于 34。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct大于或等于 34则为阴性,如果小于或等于 30则为阳性。如果在 30-34之间,则重复一次。若重复结果 Ct值小于 34,扩增曲线有明显起峰,该样本判断为阳性,否则为阴性。 |
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