乳酸杆菌属通用染料法荧光定量PCR试剂盒
产品名称 Lactococcus spp. SYBR qPCR Kit 产品介绍
产品及特点 乳酸杆菌是可使葡萄糖等糖类分解为乳酸的各种细菌的总称。乳酸菌是一种无芽孢的杆菌,属革兰氏阳性菌,厌氧性呼吸。广泛分布于自然界,有些菌株是人和动物口腔、肠道及阴道的正常菌群之一,很少致病,除极偶尔引起亚急性细菌性心内膜炎外,对人基本无害。寄生于口腔的乳酸杆菌在龋齿发生中起重要作用。一般认为寄生于肠道和阴道的乳酸杆菌对机体有保护作用某些乳杆菌如嗜酸性乳杆菌、保加利亚乳杆菌,常用于饮料的发酵工业。本公司开发乳酸杆菌属通用染料法荧光定量 PCR试剂盒,它具有下列特点: 1、即开即用,用户只需要提供 DNA模板。 2、引物根据乳酸杆菌属专一区设计,特异性高。 3、荧光定量 PCR检测,比常规 PCR更加灵敏。 4、一管式闭管操作,降低了交叉污染。 5、本试剂盒足够 50次 20μL反应体系的荧光定量 PCR。 6、本产品只适用于科研,不能用于临床诊断。 规格及成分
运输及保存 低温运输、-20℃保存,有效期一年。 自备试剂 DNA模板、10×ROX(根据机型决定,具体见使用方法)。 使用方法 一、稀释 PCR阳性对照(以 102-107拷贝/μL这 6个 10倍稀释度为例) 1、注意:由于阳性对照浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供可以直接使用的 DNA片段作为阳性对照。 2、标记 6个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。 3、用带芯枪头分别加入 45 μL荧光 PCR专用模板稀释液(**用带芯枪头,下同)。 4、在 7号管中加入 5 μL 1×108拷贝/μL的阳性对照,充分震荡 1分钟,得1×107拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。 5、换枪头,在 6号管中加入 5 μL 1×107拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡 1分钟,得 1×106拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。 6、换枪头,在 5号管中加入 5 μL 1×106拷贝/μL的阳性对照到 5号管中,充分震荡 1分钟,得 1×105拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。 7、重复上面的操作直到得到 6个稀释度的阳性对照。放冰上待用。 二、样品 DNA的制备 8、如果有 N个样品,必须设置 N+2个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照),一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL PCR阳性对照的 10000倍稀释的(稀释后浓度为 1×104拷贝/μL,10μL相当于 1万拷贝,可以将 10μL原液加入到 990μL自备 TE溶液中,充分混匀,此为 100倍稀释液。再取 10μL此稀释液加入到 990μL自备 TE溶液中,充分混匀,此为 10000倍稀释液)再加上一定量的水作为制备的阳性对照(加水后其总体积跟样品一样,样品体积多少取决于所用试剂盒的要求)。可以用水作为制备的阴性对照。制备所得成为样品 DNA。 9、用自选方法纯化 N+2个样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数核酸提取试剂盒兼容。本试剂盒免费赠送 20次核酸释放剂试用装。 三、设置 qPCR反应(20 μL体系,在样品制备室进行) 10、如果做定量分析并且只做 1次重复,则标记 N+9个 PCR管,其中 N+2个用于上步得到的 N+2个样品,1个用于 PCR阴性对照,6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做 1次重复,则标记 N+4个 PCR管,其中 N+2个用于上步得到的 N+2个样品,1个用于 PCR阴性对照(用水做模板),1个用于 PCR阳性对照(用第 4号阳性对照稀释液,浓度为 14810拷贝/μL)。下面只描述定量分析的步骤,定性分析只是把 6个标曲反应缩减成 1个,其余不变。 11、在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
注:仅 ABI7500、7700和 7900仪器需要使用 ROX作为对照,其他荧光 PCR仪器(如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene 3000、RotorGene 6000和 LightCycler480)不需要使用 ROX,则用水替代。 12、盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR(具体 PCR参数可以根据仪器不同而自行优化)。
四、数据处理 13、如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log值为横轴,以 Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct值从标准曲线上推算出样品 cDNA浓度的 log值,再推算出其浓度。 14、如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct必须大于或等于 37。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于30。对待测样品,如果其 Ct大于或等于 37则为阴性,如果小于或等于 35则为阳性。如果在 35-37之间,则重复一次。重复实验的 Ct值如果大于或等于 37则为阴性,如果小于 35,则为阳性。 |
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